Er zijn verschillende methodes voor het verwijderen van galstenen. De beste methode is een operatie waarbij de galblaas wordt verwijdert. Omdat de galblaas alleen maar als opslagplaats dient voor de galvloeistof veroorzaakt het verwijderen maar weinig of geen problemen. Als reactie op het verwijderen kan men een paar dagen last hebben van dunne ontlasting of diarree. De operatie kan op twee manieren uitgevoerd worden, een kijkoperatie of een buikoperatie. Meestal wordt in overleg met de arts de beste manier gekozen.

Als galstenen niet operatief verwijdert kunnen worden dan wordt, als de galstenen niet in de galblaas zitten een endoscoop gebruikt. Met een endoscoop kan de arts via de mond galstenen uit de galwegen halen, als de galstenen in de galblaas zitten dan is dit niet mogelijk. Als de endoscoop niet mogelijk is en ook een operatie niet wenselijk is dan kunnen kleine galsteentje via medicijnen opgelost worden. Bij een endoscopie en medicijnenkuur kunnen galstenen wel terug komen.

In sommige landen gebruikt men de niersteenvergruizer ook voor galstenen, in Nederland is men hiermee gestopt omdat het vinden van de locatie soms moeilijk is waardoor vergruizen van de galstenen ook moeilijker is. Ook kunnen tijdens het vergruizen sommige fragmenten gevaar opleveren omdat ze nog groot zijn en nauwe doorgangen kunnen afsluiten zoals de alvleesklier. Ook heeft een galblaasoperatie het voordeel dat nieuwe galstenen bijna niet meer kunnen ontstaan en bij vergruizen kan dat wel. De meest effectieve methode tegen galstenen is het verwijderen van de galblaas en niet alleen de galstenen verwijderen.