Moeilijk naar de wc kunnen is voor veel mensen hetzelfde als een slechte stoelgang hebben. Toch zijn deze twee dingen iets anders, hoewel de uitkomst hetzelfde kan zijn is de oorzaak elders te zoeken. Een moeilijke stoelgang is vaak eerder en gemakkelijker op te lossen dan een slechte stoelgang. Een slechte stoelgang heeft invloed op het hele spijsverteringssysteem omdat de oorzaak al voor de endeldarm ligt. Bij een moeilijke stoelgang is de uitscheiding bij de endeldarm meestal het grootste probleem. Een ander verschil is dat bij een slechte stoelgang vaak de darmwanden geïnfecteerd raken.
Een slechte stoelgang wordt meestal veroorzaakt door een slecht bewegende darm. De darm die normaal bewegingen maakt om de voedingsmiddelen te verplaatsten maakt nu krampachtige bewegingen wat abnormaal samentrekken veroorzaakt waardoor de voedselbrij geen normaal traject kan afleggen. Er kunnen resten achterblijven die ontstekingen kunnen veroorzaken en er kan vocht worden onttrokken aan de brij. Door de slechte stoelgang wordt het hele spijsverteringsstelsel verstoord. De darmflora die uit goede bacteriën bestaat kan de aanvallen van de slechte bacteriën niet meer aan en er ontstaan infecties aan de darmwand.
Het gevolg van een slechte stoelgang is het prikkelbare darm syndroom, de darmen kunnen hun werk niet meer goed doen, er kunnen infecties aan de darmwand optreden omdat de darmflora is verstoord, de darm is dus prikkelbaar. Omdat deze aandoening niet slechts eenmalig maar terugkerend is noemen we het een syndroom. Typische klachten van een prikkelbare darm syndroom zijn een opgeblazen gevoel omdat men een slechte stoelgang heeft en buikkrampen.