Onderzoek door een arts kan duidelijkheid geven voor wat voor soort pollen men gevoelig is. Tijdens het gesprek moet men aangeven in welke periode de allergische reacties optreden en wat de weersomstandigheden dan zijn
Immunotherapie ( in de vorm van allergievaccinatie) is een vorm van behandeling die niet enkel de klachten bestrijdt maar eveneens de onderliggende oorzaak van de kwaal aanpakt. Bij een dergelijke vorm van behandelen kan een hooikoortspatiënt ongevoelig gemaakt worden voor de pollen waar deze gevoelig voor is. Dit gebeurt door steeds een kleine hoeveelheid allergenen toe te gaan dienen.
Klachten die door hooikoorts veroorzaakt worden kunnen bestreden worden met zogenaamde symptomatische medicatie. De behandeling is er daarbij op gericht om de klachten onder controle te krijgen. Er zijn diverse geneesmiddelen in verschillende toedieningsvormen die verlichting van de klachten kunnen geven. Symptomatica kunnen afhankelijk van de soort en de functie, te verkrijgen in de vorm van oogdruppels, tabletten en een neusspray.
Medicijnen om de klachten van hooikoorts te kunnen bestrijden kunnen op worden gedeeld in drietal soorten: decongestiva, antihistaminica en corticosteroïden. In sommige gevallen kan het nodig zijn om meerdere middelen te gebruiken om van alle klachten verlost te worden. Zo kan bijvoorbeeld het ene middel de jeuk in de ogen tegengaan terwijl een ander middel gebruikt wordt om de verstopte neus te kunnen behandelen. Daarnaast kan soms blijken dat een combinatie van middelen een beter effect heeft op een bepaalde klacht dan wanneer men slechts één enkel medicijn gebruikt. Symptomatica kunnen tijdelijk de allergische klachten verlichten.