Veel mensen vinden wratten vervelend en niet mooi. Bij kinderen bestaat vaak het krabprobleem waardoor het aantal wratten groeit. Er bestaan verschillende meer- en minder ingrijpende manieren om wratten te verwijderen. Bij kinderen wordt vaak gekozen voor het zelf aanstippen met speciale druppels of zalf waardoor de wrat zacht wordt en gemakkelijk verwijdert kan worden. Tijdens het wratten spreekuur bij de huisartsen wordt gebruik gemaakt van de stikstof methode, om de week wordt de wrat bevroren met vloeibare stikstof waarna tijdens het ontdooien de cellen afsterven.
Veel volwassenen kiezen voor het laseren waardoor de wratten snel weggebrand worden. Laser is meestal een kostbare methode die men zelf moet betalen. Een andere mogelijkheid die door de huisarts wordt gedaan is het wegschrapen van de wratten, gecombineerd met een behandeling van vloeibare stikstof. Als wratten hardnekkig terug blijven komen kan gekozen worden voor een behandeling die gebruikt wordt bij de bestrijding van kanker. Men spuit een beetje chemotherapeuticum in de wratten om het virus te bestrijden. Een andere meer ingrijpende methode is het chirurgische laten verwijderen van wratten, een nadeel is de littekentjes die achterblijven.
Bij elke behandeling bestaat de mogelijkheid dat wratten terugkomen en men opnieuw behandeld moet worden. Veel artsen zijn tot de conclusie gekomen dat het beter is om niets te doen omdat de meeste wratten na een jaar vanzelf verdwijnen. Slechts twintig procent van de wratten verdwijnt niet of heeft een langere periode nodig, in dit geval zou men dan een goed doordachte behandeling kunnen overwegen.